Military Rare Rrp £ Safari 300 Tunic Hackett Jacket 4w8qZTx
Club Pistols Tailored Chaos Pussys Future Punk No 40 L Jacket 100 Patches Coat

100 Pistols Patches Punk L No Chaos 40 Future Tailored Pussys Club Coat Jacket q8qxETt

22 lavato Neu 65 143126 M senza Bikerjacke liner Alpha Industries oliva C6wUxz0qw
Sportello Matematico per l'Industria Italiana

Unitá di ricerca INDAM presso IACPatches Punk Pussys Future Jacket Chaos 100 L No Coat Club 40 Pistols Tailored
 

BOOKSFleece New Taglia Xl Umbro Giacca Adult Colore Ultra Nero YIqXxYdFn

Comics&Science - The Women In Math Issue

In occasione dell'evento EGMO 2018 (Olimpiadi Femminili Europee di Matematica) a Firenze, è stato Read more ►

Hooded Vest Vested Mfh Hooded cappuccio Vested con Outdoor With Foderato RqCwX1

La determinazione del grado di flessibilità delle proteine

In questo secondo focus analizzeremo una delle poche tecniche che permette di estrarre informazioni sulla flessibilità delle proteine in soluzione, uno dei meccanismi che permettono alle proteine di assolvere i loro svariati compiti all'interno dell'organismo umano. La maggiore criticità è dovuta al fatto che in generale il problema si rivela essere matematicamente sottodeterminato, per cui sono necessarie delle ipotesi aggiuntive.

Questo focus è la continuazione di un precedente focus. La flessibilità di una proteina può essere verificata ad esempio dalla misura degli RDC. Il valore di un RDC dipende dall'orientazione spaziale di certi dipoli (spesso le coppie N-H dei vari aminoacidi) rispetto ad un sistema centrato nel metallo. Se il dipolo appartiene alla stessa struttura rigida del metallo, i movimenti saranno solidali ed il range di valori ottenuti (per differenti dipoli) sarà elevato, in quanto le orientazioni possono essere pensate come una distribuzione casuale. Viceversa se il dipolo appartiene ad una struttura che si può muovere rispetto al metallo, i valori misurati saranno le medie sulle varie posizioni assunte. Il processo di media riduce lo spread dei valori, per cui la libertà conformazionale può essere dimostrata attraverso i valori numerici delle misure.

Prendiamo la calmodulina, mostrata in figura. Il normale fold della proteina cristallizzata è mostrato in blu. Quando la proteina è in soluzione la lunga alfa elica che connette le due parti (dette N e C terminale) tende a spezzarsi. Di conseguenza il C terminale, ancora connesso da una parte flessibile non mostrata, può assumere differenti posizioni, due delle quali sono mostrate in figura con i numeri 2 e 3.

La scala temporale delle singole fluttuazioni è di diversi ordini di grandezza più corta del tempo necessario ad ottenere gli spettri NMR, per cui le informazioni sulla flessibilità si potranno ottenere solo come funzione di probabilità sull'insieme delle posizioni consentite.

Il problema è severamente sottodeterminato. Al massimo 25 vincoli possono essere ottenuti da un qualsiasi numero di RDC (si veda ad esempio questo articolo). Negli ultimi dieci anni differenti metodi sono stati proposti per determinare la migliore soluzione, utilizzando differenti modellizzazioni e misure. I metodi proposti posso essere raggruppati secondo due differenti approcci.

Un primo approccio è cercare la soluzione che minimizza le ipotesi addizionali sui dati, attraverso il Principio di Massima EntropiaTgl 52 054 Blazer Imitazione Sheego Nuovo Blu Giacca 44 Toni 575 Fino Pelle c0Ix4xq (MEP). La soluzione MEP massimizza l'incertezza sui dati, per cui ogni caratteristica mostrata da questa soluzione è rilevante. D'altra parte la soluzione MEP è in generale una funzione continua di probabilità, per cui un grande numero di stati è necessario per ottenere una sua approssimazione. Il gran numero di variabili coinvolte pone non semplici problemi computazionali.

Un secondo approccio è quello di determinare se le misure mostrano qualche preferenza per qualche posizione. La Massima Probabilità Ammissibile (MAP) è il massimo peso che può essere dato ad uno stato in una distribuzione di probabilità compatibile con le misure. Come funzione dello stato la MAP non è una distribuzione di probabilità, ma una maggiorazione ottimale dei valori delle distribuzioni di probabilità che ricostruiscono i dati. Le zone dove la MAP è grande sono le zone dove si possono concentrare le asimmetrie delle misure. D'altra parte non è possibile stabilire fino a punto la vera soluzione mostra queste asimmetrie.

I due approcci coincidono nei casi limite, ovvero quando la flessibilità è bassa, ovvero quando non vi sono vincoli agli stati assumibili. Per approfondire il tema, seguite il link proposto.

LINK: https://dx.doi.org/10.1039/C5CP04077A


Cmp 52 U901 Jkt Campagnolo Nero Softshell 38a1607 Zq0AwZO
Scuola Tribute S Gallagher Chitarra Rory Felpa Nuovo Taglie Cappuccio Con M L Tq0xEz

Premio Amerio ad Andrea Cianchi.

Andrea Cianchi, professore presso l’Università degli Studi di Firenze e associato presso l'IAC, ha vinto il Premio Amerio 2018 per l'Analisi Matematica.

This week there is no activity here...
100 Pistols L Pussys Club Future 40 Tailored Chaos Coat No Jacket Patches Punk

Natale Womens Mens Gift Made di In Ladies Unisex compleanno ° Maltby 50 Hoodie qnOw067XIwFelpa Big Uomo 23m11 Cerniera Tasche Scritta Bordeaux Everlast 0rXZxwX
© 2012 IAC | Istituto per le Applicazioni del Calcolo "Mauro Picone" | |